フリーランスエンジニアの手取りはどれくらい？計算方法と年収別目安

フリーランスエンジニアの手取りの決まり方

まずは手取りがどう決まるのか、会社員と対比して見ていきましょう。会社員は税金や社会保険料が給与から天引きされ、口座に振り込まれた額がほぼ手取りです。一方でフリーランスは、受け取った報酬から自分で経費や税金を支払い、残った金額が手取りになります。

会社員の場合

• 給与が決まる

• 社会保険料・厚生年金・所得税などが天引きされる

• 残りが口座に振り込まれる（これがほぼ手取り）

フリーランスの場合

• クライアントからの報酬が収入になる

• 収入がいったん口座に振り込まれる

• 国民健康保険料・国民年金・住民税・所得税・経費などを自分で支払う

• 残った金額が手取りになる

つまりフリーランスは、収入のうち税金・社会保険料・経費にあたる部分が大きくなるほど手取りが減ります。具体的に何にいくら払うのかを、次の章で順番に見ていきます。

なお、収入そのものの目安を知りたい方は、フリーランスエンジニアの単価相場と単価の上げ方もあわせて参考にしてください。

フリーランスエンジニアの収入から引かれる税金・社会保険料の種類

フリーランスエンジニアの手取りを左右する主な項目は、国民健康保険料・国民年金・住民税・所得税の4つです。 売上規模やインボイス登録の有無によっては、消費税も加わります。フリーランスエンジニアの収入から差し引かれる項目を順に見ていきましょう。

なお、この章の金額は執筆時点（2026年）で確認できる制度・料率をもとにしています。料率や保険料・控除額は毎年のように改正されるため、実際に申告するときは必ず一次情報で最新の数値を確認してください。

• 国民健康保険料

• 国民年金保険料

• 住民税

• 所得税

• 個人事業税（エンジニアは原則対象外）

• 消費税（売上規模やインボイス登録の有無による）

国民健康保険料

会社員から独立すると、勤務先の健康保険を抜け、国民健康保険（国保）に加入します。保険料は前年の所得をもとに計算され、料率や上限額は自治体ごとに異なるのが特徴です。

国保の所得割は、前年の所得から基礎控除43万円を引いた「旧ただし書き所得」に料率をかけて計算します。たとえば東京都渋谷区の令和8年度（執筆時点で確認できる料率。毎年改定されます）は、所得割が医療分7.51％＋後期高齢者支援金分2.80％の合計10.31％、均等割が1人あたり年65,200円です（40歳未満で介護分なしの場合）。40〜64歳はこれに介護分が加わります。

自分の保険料は、お住まいの自治体のサイトに試算ツールが用意されている場合があります。国保のほかに任意継続や建設国保という選択肢もあるため、独立直後はどれが得かを比べると良いでしょう。詳しくはフリーランスエンジニアの健康保険の選び方で解説しています。

国民年金保険料

国民年金保険料は全員一律で、年度ごとに改定されます。令和8年度（2026年4月〜2027年3月）の保険料は月額17,920円です。直近の推移は次のとおりです。

最新の金額は日本年金機構で確認できます。将来の年金額を増やしたい場合は、付加年金・国民年金基金・iDeCoといった上乗せの選択肢もあります。詳しくはフリーランスエンジニアの年金対策を参照してください。

住民税

住民税は、お住まいの自治体に納める地方税です。前年の所得をもとに計算され、所得割と均等割で構成されます。

• 所得割：（前年の所得 − 所得控除）× 10％（市区町村民税6％＋道府県民税4％）から、調整控除などを差し引いた額

• 均等割：所得にかかわらず定額。標準は年5,000円（市区町村民税3,500円＋道府県民税1,500円）

• このほか、令和6年度から森林環境税（国税）が年1,000円、住民税とあわせて徴収されています

住民税の基礎控除は43万円です。所得税の基礎控除は後述のとおり令和7年分から引き上げられましたが、住民税の基礎控除は43万円のまま据え置きとなっている点に注意してください。

所得税

所得税は、所得に対してかかる国税です。税額は所得が多いほど高くなる累進課税で、税率は次の速算表のとおりです（国税庁）。

課税の対象は、経費や各種控除を差し引いたあとの「課税所得」です。このほかに復興特別所得税（基準所得税額の2.1％）が加算されます。

ここで押さえておきたいのが基礎控除の改正です。令和7年度税制改正により、合計所得金額2,350万円以下の人の基礎控除が48万円から58万円に引き上げられました。さらに令和7年分・令和8年分に限り、合計所得金額に応じて上乗せされます。

この上乗せは令和7・8年分の暫定措置で、令和9年分以降は2,350万円以下で一律58万円となる予定です。改正の詳細は国税庁の案内を確認してください。同じ収入でも、改正前より課税所得が下がり、所得税は軽くなります。

個人事業税

個人事業税は、地方税法で定められた事業に対してかかる税金です。対象となる業種は決まっており、エンジニアの開発業務は原則として対象外です。ただしWeb制作でデザインの比重が大きい場合など、業務内容によっては対象になることもあります。自分の業務が該当するかは、お住まいの都道府県の主税局（東京都の場合は東京都主税局）で確認しておくと安心です。

消費税

消費税は、売上規模とインボイス登録の有無で、納める・納めないが分かれます。 消費税は、事業者として受け取った消費税を国に納める税金です。基準期間（原則2年前）の課税売上高が1,000万円以下なら、免税事業者になれるのが基本ルールです。納税義務が生じるかどうかは、その年の売上ではなく2年前の売上で判定される点に注意してください。

ただし、インボイス制度に登録すると、売上が1,000万円以下でも課税事業者になります。取引先がインボイスを求めるかどうかで、登録すべきかの判断が変わります。納税額は、簡易課税（サービス業のみなし仕入率は50％）や、登録事業者向けの2割特例など、選ぶ方法で大きく変わります。インボイスへの対応はインボイスとは？フリーランスエンジニアが知るべきポイントで詳しく解説しています。

フリーランスエンジニアの手取り目安（年収別早見表）

単身・渋谷区・経費3割の前提では、手取りは額面年収の5〜6割程度が目安です。 以下はその試算例です。手取りは経費・自治体・控除の使い方で変わるため、次の前提で試算した簡易概算として捉えてください。

• 経費：収入の30％

• 住まい：東京都渋谷区（令和8年度の国保料率を使用）

• 年齢：32歳（介護保険分なし）、未婚・扶養家族なし

• 青色申告特別控除：65万円

• 国民年金：令和8年度の月17,920円（年215,040円）

• 国民健康保険料・国民年金は社会保険料控除として所得から差し引いて計算

• 所得税は令和7・8年分の基礎控除、住民税は基礎控除43万円で計算

• 調整控除・税額控除などの細かい調整は省略

• 想定する読者：案件単価が月45万〜100万円程度で、1人で開発案件を請ける個人事業主

実際の額は個別事情で変わります。正確な数字は自治体の国保試算ツールや国税庁の情報、税理士への相談で確認してください。

※1,080万円・1,200万円は、すでに消費税の課税事業者になっている年を想定し、簡易課税（みなし仕入率50％）で概算しています。実際には納税義務は2年前の売上で判定されるため、売上が1,000万円を超えた年からすぐに発生するわけではありません。原則課税や2割特例では金額が変わります。

計算の流れ（年収720万円の例）

数字の出し方を、年収720万円のケースで追ってみます。

1. 経費：720万円 × 30％ ＝ 216万円

2. 事業所得（合計所得金額）：720万円 − 216万円 − 青色65万円 ＝ 439万円

3. 国民健康保険料：旧ただし書き所得（439万円 − 43万円）に料率10.31％と均等割を加えて約47.3万円

4. 社会保険料控除：国保47.3万円 ＋ 国民年金21.5万円 ＝ 約68.8万円

5. 所得税：事業所得から社会保険料控除と基礎控除（439万円は68万円）を引いた課税所得に税率を適用して約20.9万円

6. 住民税：同様に基礎控除43万円で計算し、均等割・森林環境税を加えて約33.3万円

7. 手取り：720万円 −（経費216万円＋国保47.3万円＋年金21.5万円＋住民税33.3万円＋所得税20.9万円）≒ 約381万円

このように、額面の年収から3〜4割ほどが経費・税金・社会保険料に回るのが一つの目安です。経費率や控除の使い方で、手取りは上下します。

フリーランスエンジニアが手取りを増やす方法

手取りを増やす方向は、大きく3つに分けられます。

収入を増やす

最もシンプルなのは、単価を上げて収入そのものを伸ばすことです。スキルや実績を整理し、根拠を持って交渉すれば、単価は動きます。具体的な進め方は単価交渉のコツで解説しています。

ただし、収入を増やすときに意識したいのが売上1,000万円の境目です。早見表でも、年収960万円（手取り約488万円）と年収1,080万円（手取り約485万円）はほぼ並んでいます。これは売上1,000万円を超えると、原則として2年後に消費税の納税義務が生じるためです。簡易課税や2割特例で負担はやわらぐものの、境界付近では手取りが伸び悩むことがあります。大きく超える見込みなら、マイクロ法人などの選択肢を検討する余地もあります。

高単価の案件を探すなら、フリコンの案件検索で実際の単価感を確かめてみてください。

各種控除を活用する

控除を使うほど課税所得が下がり、所得税・住民税が軽くなります。フリーランスエンジニアが使いやすい主な控除は次のとおりです。

• 青色申告特別控除：要件を満たすと最大65万円。詳しくは青色申告と白色申告の違い

• 小規模企業共済等掛金控除：iDeCoや小規模企業共済の掛金が全額控除

• 医療費控除・生命保険料控除・地震保険料控除 など

これらを組み合わせた節税の全体像は、フリーランスエンジニアの節税対策で整理しています。

経費を漏れなく計上する

仕事に関係する支出は経費に計上できます。パソコン・モニター・通信費のほか、自宅兼事務所なら家賃や光熱費を業務分だけ按分して計上します。按分は面積や使用時間など、説明できる根拠をもとにするのが基本です。どこまで経費にできるかは経費にできるもの一覧を参考にしてください。

控除も経費も、人によって使えるもの・使えないものがあります。売上が大きくなってきたら、一度税理士に相談すると、抜け漏れを防げます。費用は売上規模や依頼範囲で大きく変わるため、複数の事務所に見積もりを取ると判断しやすくなります。

まとめ

フリーランスエンジニアの手取りは「収入 −（経費＋税金＋社会保険料）」で決まり、額面のおおむね6割前後が目安です。会社員と違い天引きされないため、何にいくら払うのかを自分で把握しておくことが大切です。

• 主な負担は国民健康保険料・国民年金（令和8年度は月17,920円）・住民税・所得税の4つ

• エンジニアは個人事業税が原則かからない。消費税は売上1,000万円とインボイス登録が判断の分かれ目

• 令和7年分から所得税の基礎控除が引き上げられ、手取りは増える方向。住民税の基礎控除は43万円で据え置き

• 手取りを増やす軸は「収入を増やす」「控除を使う」「経費を計上する」の3つ

• 正確な税額・保険料は個別事情で変わるため、最終的には国税庁・自治体・年金機構の情報や税理士への相談で確認する

収入の底上げから始めたい方は、まずフリコンの案件検索で今の自分のスキルがどのくらいの単価で募集されているかを確かめてみてください。無料の単価査定もあわせて使うと、手取りを増やす計画が立てやすくなります。

なお本記事は一般的な情報提供を目的としたもので、税務上の助言ではありません。実際の申告・納税にあたっては、税理士などの専門家にご確認ください。

参考にした一次情報は次のとおりです。

• 国税庁｜所得税の税率

• 国税庁｜令和7年度税制改正による基礎控除の見直し

• 日本年金機構｜国民年金保険料

• 渋谷区｜国民健康保険料